男生器官上长小黑点可能是色素沉着、痣、皮脂腺异位症或感染炎症等原因引起。不同情况需不同对待，如有异常应及时就医。
1、色素沉着：男生器官上出现小黑点，可能是正常的色素沉着，就如同身体其他部位的皮肤一样，随着年龄的增长、局部摩擦等因素，可能会出现色素沉淀，小黑点通常是孤立的、无凸起、无疼痛或瘙痒等不适症状，一般无需特殊处理。
2、毛囊炎：是毛囊部位发生的炎症反应，可能与细菌感染有关。在患病后，由于炎症刺激，局部可能出现红色丘疹，并可能伴有瘙痒和疼痛的症状。如果毛囊炎消退后，可能会留下色素沉着，表现为小黑点。
3、包皮龟头炎：是指阴茎龟头部由外伤、刺激或感染等因素引起的炎症，炎症可能导致局部皮肤颜色发生变化，出现小黑点或黑斑。
4、尖锐湿疣：是由人乳头瘤病毒感染引起的一种性传播疾病，在患病初期，可能会在肛门和外生殖器部位出现小颗粒状物体，并逐渐增多，形成菜花状、鸡冠状等赘生物。这些赘生物可能呈现黑色或深褐色，表现为小黑点。
5、黑色素瘤：虽然较为罕见，但黑色素瘤是一种恶性程度较高的肿瘤，可能与遗传因素、长期日晒等原因有关。在男性生殖器上，黑色素瘤可能表现为黑色结节或黑斑，并伴有疼痛、瘙痒等症状。
男生如果发现器官上有小黑点，不要惊慌。在日常生活中应注意个人卫生和性健康，避免不洁性生活和过度摩擦等行为以减少患病风险。